|
چکیده
|
بیماری اسکلروز جانبی آمیوتروفیک ( )ALSیک بیماری نورودژنراتیو است و در اثر جهشهای تک ژنی ایجاد میشود. این بیماری که به دو دسته خانوادگی ( )fALSو پراکنده ( )SALSتقسیم میشود، در اثر جهش در ژن SOD1به وجود میآید. ما در این مطالعه به بررسی تاثیر دو جهش L67Pو D76Yبر پایداری ساختار و عملکردی SOD1پرداختیم. جهت انجام این بررسی، ابتدا توالی SOD1توسط پایگاه داده UniProtبه دست آمد و سپس اثرات جهش ها ( L67Pو )D76Yبر روی عملکرد پروتئین، فعالیت و بیماری زایی SOD1توسط سرور یکپارچه Predict SNPبا 2 الگوریتم) ( PMUT ,SNP&GOمورد تجزیه و تحلیل قرار گرفت. جهت بررسی پایداری ساختار آنزیمهای جهشیافته از روش های بیوانفورماتیکی استفاده شد. تجزیه وDUET وi-Stable( AUTO-MUTE RF، SVM AUTO-MUTE ،I-mutant ،I-mutant2.0) از جمله سرور یکپارچه تحلیل انعطاف پذیری ساختاری و انرژی ارتعاشی آنتروپی از سرور ) Dynamut (ENCoM, SDM, MUpro, Mcsmو تغییرات ساختاری با سرور Dynamut 2حاصل شد. نتایج حاصل نشان داد که جهشهای L67Pو D76Yبر روی پایداری ساختاری، فعالیت و عملکرد SOD1تاثیر میگذارد. اثر مخرب و بیماری زایی جهش یافته های L67Pو D76Yتوسط 2الگوریتم ( )PMUT ,SNP&GOپیشبینی شد. بررسیهای ساختاری آمینو اسیدها نیز نشان داد که آمینو اسیدهای جهش یافته نسبت به نوع وحشی از لحاظ اندازه و بار الکتریکی دچار تغییرات شدهاند. همچنین انعطاف پذیری ساختاری نیز در اثر جهش دچار تغییرات شدهاند که منجر به افزایش آنتروپی و تغییرات پایداری شده است. به طور کلی، یافته های حاصل از مطالعه ما بینشی در مورد تأثیر جهش بر پروتئین SOD1ایجاد کرد که به نوبه خود منجر به اختلال نورودژنراسیون در انسان می شود. در نتیجه، این مطالعه درک مکانیسم نظری مربوط به جهشهای D76Yو L67Pدر SOD1و متعاقبا تاثیر آنها بر روی بیماری ،fALSرا تسهیل می کند
|