محورهای همایش میکروبیولوژی صنعتی و فناوری های نوین میکروبیولوژی غذایی و پروبیوتیک ها میکروبیولوژی پزشکی، دارو و سلامت میکروبیولوژی در کشاورزی و منابع طبیعی میکروبیولوژی دریا، آبزیان و شیلات میکروبیولوژی آب و پساب بیوتکنولوژی میکروبی و نانوبیوتکنولوژی میکروبیولوژی و تولید محصولات طبیعی و مصنوعی میکروبیولوژی محیطی، تنوع زیستی و اکولوژی میکروارگانیسم ها
