|
چکیده
|
ویروس موزاییک معمولی لوبیا (Bean common mosaic virus, BCMV) (جنس Potyvirus) یکی از مخربترین و شایعترین ویروسهای لوبیا در دنیا است که باعث بروز علایم موزاییک و ایجاد خسارت در گیاه لوبیا میشود. به منظور بررسی تنوع ژنتیکی این ویروس در شمال ایران، در سال 1393 تعداد 100 نمونه برگ دارای علائم ویروسی از مزارع لوبیا استانهای مازندران و گلستان جمع آوری و RNA کل آنها استخراج شد. در آزمون RT-PCR با استفاده از آغازگرهای اختصاصی طراحی شده، قطعهای به طول 860 جفت نوکلئوتید از ژن پروتئین پوششی (coat protein, CP) ویروس در 48 نمونه تکثیر گردید. محصول PCR شش جدایه پس از همسانهسازی در حامل pTG19-T توالییابی گردید. در آنالیز فیلوژنتیکی 28 ترادف، BCMV در 3 گروه (I، II و III) قرار گرفتند و هر گروه به دو زیرگروه (A, B) تقسیم شد. جدایه های مازندران در کنار دو جدایه آمریکا در زیرگروه IB قرار گرفتند در حالیکه جدایههای گلستان در زیرگروه IA قرار گرفتند. آنالیز فیلوژنتیکی جدایه های تعیین ترادف شده در ناحیه ژنی CP نشان داد که جدایه های تعیین توالی شده دارای 87.9-98.6% شباهت با جدایه های موجود در بانک ژن در سطح نوکلئوتیدی هستند. جدایه های مازندران بیشترین شباهت (96-96.9%) را با جدایه RU1M (از آمریکا) و کمترین شباهت (87.9-88.3%) را با جدایه Habin 1 (از کره جنوبی) در سطح نوکلئوتیدی دارند، در حالیکه جدایه های گلستان بیشترین شباهت (98.3-98.6%) را با جدایه NL1 (از آمریکا) و کمترین شباهت (88.5-88.7%) را با جدایه Habin 1 دارند. همچنین تشابه توالی نوکلئوتیدی جدایه های مازندران با جدایه های گلستان 91.4% می باشد.
|