عنوان
|
تمایز ژنتیکی و رابطه فیلو ژنتیکی سفیدپلت (Populus caspica) و سپیدار (Populus alba) با استفاده از مارکر های مولکولی cpDNA (trnH-psbA) و ITS (Genetic Differentiation and Phylogenetic Relationship of Populus caspica & Populus alba using cpDNA (trnH-psbA ) and ITS Molecular Markers)
|
نوع پژوهش
|
پایان نامه
|
کلیدواژهها
|
Populus caspica، Populus alba، تمایز ژنتیکی، بارکد دهی DNA، جنگل هیرکانی
|
چکیده
|
سفید پلت (Populus caspica) متعلق به بخش Leuce و زیر بخش Albidae می باشد که یکی از گونه های بومی و درختی ممنوع القطع جنگل های هیرکانی است که به دلیل شباهت ریختی فراوان با سپیدار (P. alba) همواره جایگاه متمایز تاکسونومی آن سوال برانگیز است. این تحقیق به منظور بررسی تمایز جایگاه تاکسونومی P. caspica و P. alba با استفاده از جایگاه غیر کننده ی کلروپلاستی (trnH-psbA) و داده های جایگاه ITS فاصله انداز رونویسی شونده داخلی (Internal Transcribed Spacer) انجام پذیرفت. نمونه های برگی از 8 جمعیت کوچک در منطقه ی شمال ایران جمع آوری شدند. DNAی ژنومی از برگ نمونه ها با استفاده از روش عمومی فنل/کلروفرم استخراج گردید. پس از تایید کیفیت DNA استخراجی از طریق بارگذاری روی ژل اگارز و دستگاه اسپکتوفتومتری، قطعات cpDNA و ITS توسط آغازگرهای عمومی با تکنیک PCR تکثیر شدند سپس به طور مستقیم تعیین توالی گردیدند. نتایج نشان داد که نه تنها P. caspica با گونه ی P. alba از لحاظ درصد نوکلئوتیدی متفاوت است، بلکه با رسم درخت فیلوژنی بر اساس داده های حاصل از تعیین توالی دو قطعه ی ITS و trnH-psbA مشخص شد که جایگاه قرارگیری و کلاد مربوط به این دو گونه نیز باهم متفاوت است. همچنین دو نوع باند با اندازه های متفاوت از تکثیر ITS در بعضی از نمونه های P. caspica مشاهده شدند. آنالیز باندها با استفاده از تعیین توالی و BLAST توالی حاصل، و نیز استفاده از آنزیم های محدودکننده نشان داد که باند دوم مربوط به گونه ای از قارچ، به نام Aspergillus pseudoglaucus ، می باشد. این درحالی بود که بسیاری از گزارشات قبلی به این نکته تاکید داشت احتمالا گونه ی سفید پلت(P. caspica)، هیبرید است. تمایز بالای P. caspica با سایر گونه های جنس صنوبر، بیانگر جایگاه تاکسونومی ویژه ی این گونه ی در خطر انقراض است و حفاظت برخی از مناطق در خطر انقراض این گونه در جنگل های هیرکانی توصیه می شود.
|
پژوهشگران
|
حامد یوسف زاده (استاد راهنما)، اباصلت حسین زاده کلاگر (استاد راهنما)، عفت یوسفی گل افشانی (دانشجو)
|