۱۴۰۴/۰۲/۰۱
ملیحه سادات عطری

ملیحه سادات عطری

مرتبه علمی: استادیار
ارکید:
تحصیلات: دکترای تخصصی
اسکاپوس:
دانشکده: دانشکده علوم پایه
نشانی:
تلفن: ۰۱۱۳۵۳۰۲۴۰۷

مشخصات پژوهش

عنوان
ارزیابی برهمکنش آلبومین سرم گاوی با میواینوزیتول توسط روش‌های طیف سنجی و داکینگ مولکولی
نوع پژوهش
پایان نامه
کلیدواژه‌ها
برهمکنش پروتئین-لیگاند ، آلبومین سرم گاوی، میواینوزیتول، طیف‌سنجی فلورسانس
سال 1403
پژوهشگران هاله لطیفی(دانشجو)، مهدی علی جانیان زاده(استاد مشاور)، ملیحه سادات عطری(استاد راهنما)

چکیده

آلبومین سرم (SA) فراوان‌ترین پروتئین پلاسما در پستانداران است. آلبومین ظرفیت بالایی برای اتصال به لیگاند‌ها دارد و به عنوان یک ناقل برای طیف متنوعی از متابولیت‌ها، داروها، مواد مغذی و سایر مولکول‌ها عمل می‌کند. آلبومین سرم گاوی شباهت ساختاری (76%) با آلبومین سرم انسان دارد. میواینوزیتول نیز یکی از قند-الکل‌های بیولوژیکی فعال است که افزایش و یا کاهش آن با بیماری‌های مختلفی از جمله سرطان و صرع و غیره مرتبط است. علاوه بر آن میواینوزیتول بخشی از فسفولیپیدهای غشایی را تشکیل می‌دهد و همچنین منجر به تنظیم فرایند اسمزی می‌شود. کمبود میواینوزیتول منجر به بیماری‌های کبدی می‌شود و به علت نقش آن در حذف کلسترول در بهبود عملکرد قلب نیز اهمیت دارد. هدف از این پژوهش بررسی برهمکنش پروتئین آلبومین سرم گاوی با میواینوزیتول و تغییرات ناشی از این برهمکنش در ساختار آلبومین می‌باشد. برای بررسی برهمکنش از روش داکینگ مولکولی استفاده شد؛ ابتدا ساختار میواینوزیتول و آلبومین سرم گاوی از پایگاه‌داده‌های مرتبط ذخیره شد و سپس با اعمال اصلاحاتی در ساختارها برهمکنش میواینوزیتول و آلبومین سرم گاوی با نرم افزار اتوداک بررسی شد. در بررسی‌های آزمایشگاهی میواینوزیتول و آلبومین سرم گاوی از روش طیف‌سنجی فلورسانس، جذب مرئی-فرابنفش و طیف سنجی FTIR استفاده شده است و همچنین از روش DLS برای اندازه گیری سایز ذره قبل و بعد از اضافه شدن لیگاند استفاده شد. این بررسی‌ها نشان دادند که میواینوزیتول می‌تواند به آلبومین سرم گاوی پیوند شود. بر اساس نتایج به دست آمده از داکینگ مولکولی جایگاه‌های پیوندی در دو خوشه قرار گرفتند و غیر از یک حالت بقیه جایگاه‌ها در خوشه اول بودند و در بهترین جایگاه پیوندی اسید آمینه‌های آلانین 193 و والین 461 از طریق پیوند‌های هیدروفوبی و اسیدآمینه‌های آسپارتات 108، هیستیدین 145، سرین 192، آرژنین196 و آرژنین 458 از طریق پیوندهای هیدروژنی نقش اساسی را در برهمکنش آلبومین گاوی و میواینوزیتول داشتند و در نهایت G∆ بدست آمده از داکینگ مولکولی برابر باkJ 18/19- شد. در بررسی فلورسانس نیز G∆ بدست آمده برابر kJ95/16- بود و بعد از اتصال میواینوزیتول به آلبومین خاموش شدن فلورسانس مشاهده شد که این خاموش شدن می‌تواند به علت تغییر کانفورماسیون پروتئین باشد. در بررسی با روش UV-VIS در غلظت 1 میکرومولار از میواینوزیتول بیشرین جذب را شاهد هستیم. در بررسی DLS نیز با افزایش غلظت لیگاند ابتدا دو دسته ذرات بزگ وکوچک را دیدیم ولی بعد از افزایش غلظت لیگاند با نسبت مولی 5 برابر پروتئین به صورت ذرات بزرگ تجمع یافته است. در طیف سنجی FTIR نیز ناحیه cm-11700-1600که مربوط به باند آمید I می‌باشد بررسی شد و شاهد تغییر در ساختار ثانویه پروتئین و کاهش در میزان آلفا هلیکس بودیم که نشان دهنده تغیر ساختار پروتئین در اثر اتصال میواینوزیتول به آلبومین سرم گاوی می‌باشد. بطور کلی این مطالعه نشان داد که پروتئین آلبومین سرم گاوی می‌تواند به میواینوزیتول متصل شود و به عنوان حامل این دارو مورد استفاده قرار گیرد.