1403/01/09
احسان نظیفی

احسان نظیفی

مرتبه علمی: استادیار
ارکید:
تحصیلات: دکترای تخصصی
اسکاپوس:
دانشکده: دانشکده علوم پایه
نشانی:
تلفن: 01135305255

مشخصات پژوهش

عنوان
شناسایی مولکولی پوتی ویروس های مهم آلوده کننده گیاهان زراعی در شمال ایران
نوع پژوهش
مقاله ارائه شده
کلیدواژه‌ها
پوتی ویروس، آغازگر دژنره، RT-PCR، همسانه سازی، توالی یابی
سال 1395
پژوهشگران زهره مرادی ، محسن مهرور ، احسان نظیفی

چکیده

پوتی ویروس ها (تیره Potyviridae) یکی از بزرگترین گروه های ویروس های گیاهی با بیشترین اهمیت اقتصادی بوده و عامل 40% بیماریهای ویروسی در گیاهان مختلف می باشند. به دلیل آسانی انتقال این ویروس ها، ردیابی آن ها به منظور کنترل بیماری های ناشی از آن ها مهم می باشد. بدین منظور، تعدادی نمونه برگی دارای علائم ویروسی از گیاهان مختلف استان های مازندران و گلستان جمع آوری و RNA کل آن ها استخراج شد. در آزمون RT-PCR با یک جفت آغازگر دژنره مربوط به ژن CI پوتی-ویروس ها، قطعه ای به طول bp680 تکثیر گردید. محصولات PCR جدایه ها بسته به نوع گیاه میزبان همسانه سازی و تعیین توالی شدند. آنالیز بلاست توالی ها نشان داد که هر یک از آن ها با توالی یک پوتی ویروس مشابهت دارند و قطعات توالی یابی شده متعلق به ویروس Yسیب زمینی (PVY) (از سیب زمینی، گوجه فرنگی)، ویروس موزاییک زرد کدو (ZYMV) (از کدو، گوجه-فرنگی)، ویروس موزاییک هندوانه (WMV) (از کدو، هندوانه)، ویروس موزاییک معمولی لوبیا (BCMV) (از لوبیا)، ویروس موزاییک معمولی نکروز لوبیا (BCMNV) (از لوبیا)، ویروس موزاییک سویا (SMV) (از لوبیا)، ویروس موزاییک نیشکر (SCMV) (از ذرت، نیشکر) و ویروس موزاییک کوتولگی ذرت (MDMV) (از ذرت) است. در این تحقیق با استفاده از آغازگرهای دژنره مربوط به پوتی ویروس ها، گونه های مختلف مربوط به این جنس که باعث ایجاد آلودگی در طیف مختلفی از گیاهان می گردند شناسایی گردید. استفاده از آغازگرهای دژنره نه تنها ردیابی سریع پوتی ویروس های زیادی را تسهیل کرده بلکه توالی یابی قسمتی از ژنوم برای اهداف تاکسونومیکی را نیز ممکن ساخته است. The genus Potyvirus is one of the largest and economically important groups of plant viruses, due to their effects on crops worldwide. Potyviruses are accounted for 40% of viral diseases of various plants. Due to easily spreading of these viruses detection of such viruses are crucial for control of incited diseases. So, Leaf samples with virus-like symptoms were collected from a range of crops in Mazandaran and Golestan provinces of Iran. Total RNA was extracted and one pair of degenerate primers corresponding to CI-coding region of potyvirus genome was used in RT-PCR. PCR products (680bp) of representati